Mysql
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Sequela Pro com Mysql no Docker


Você esqueceu de expor sua porta de banco de dados para o host, então basta adicionar 
mysql-server:
    image: mysql
    ports: 
      - "3306:3306"
    environment:
        MYSQL_ROOT_PASSWORD: root
        MYSQL_DATABASE: drupal
        MYSQL_USER: drupal
        MYSQL_PASSWORD: drupal

E, em seguida, conecte-se ao banco de dados no Sequel Pro usando:
user: root
password: root
host: localhost
port: 3306

Se você já possui um banco de dados mysql local em execução em seu host, altere a porta 
ports: 
  - "4306:3306"

e, em seguida, conecte-se à porta 4306 em vez de 3306 . Esteja ciente de que, no contêiner Drupal, você ainda usará 3306