Instale o pacote php55-mysqlnd . Acredito que isso fornecerá suporte ao mysql para PDO.

Edit:Para suporte ao PHP 5.6, o pacote é php56-mysqlnd .

Para suporte ao PHP 7.0, o pacote é php70-mysqlnd .

Para suporte ao PHP 7.1, o pacote é php71-mysqlnd .