como alterar a cor da barra em MPandroidCharts com base em algum valor individual armazenado no sqlite?

Pelo que entendi, você deseja plotar as barras com base em bunk mas pinte-os com base em credits . Usar o conjunto de dados de barra personalizado é a abordagem certa, basta modificá-lo um pouco. O código abaixo obtém o que você está descrevendo.

Alterações que fiz:

Não é possível passar a lista de nomes para BarData , use um formatador de valor de eixo
Conjunto de dados de barra personalizado alterado para também conter os credits variedade. Não tenho certeza se seu getEntryForXIndex O método está definido em outro lugar, mas não está no código que você postou.
Removidas chamadas obsoletas e sintaxe inválida (não é possível chamar setDescription(""); )

Se não for isso que você está procurando, atualize a pergunta com mais detalhes sobre o que você está vendo etc... Até onde eu pude perceber a pergunta era sobre o gráfico e não sobre o banco de dados SQL.

@Override
protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
    super.onCreate(savedInstanceState);
    setContentView(R.layout.activity_main);

    BarChart chart = findViewById(R.id.test_chart);

    // Some made up data - replace these with your
    //  queryYdata, queryXdata, and queryZdata methods
    String[] names = new String[]{"foo","bar","fiz","bam","boo"};
    List<Float> credits = new ArrayList<>(Arrays.asList(1f,9f,2.5f,15f,50f));
    float[] bunks = new float[]{10f,15f,16f,20f,5f};

    List<BarEntry> entries = new ArrayList<>();
    for(int i = 0; i < bunks.length; ++i) {
        entries.add(new BarEntry(i, bunks[i]));
    }

    float textSize = 16f;

    MyBarDataset dataSet = new MyBarDataset(entries, "data", credits);
    dataSet.setColors(ContextCompat.getColor(this,R.color.green),
            ContextCompat.getColor(this,R.color.yellow),
            ContextCompat.getColor(this,R.color.red));
    BarData data = new BarData(dataSet);
    data.setDrawValues(false);
    data.setBarWidth(0.9f);

    chart.setData(data);
    chart.setFitBars(true);
    chart.getXAxis().setValueFormatter(new IndexAxisValueFormatter(names));
    chart.getXAxis().setPosition(XAxis.XAxisPosition.BOTTOM);
    chart.getXAxis().setTextSize(textSize);
    chart.getAxisLeft().setTextSize(textSize);
    chart.setExtraBottomOffset(10f);

    chart.getAxisRight().setEnabled(false);
    Description desc = new Description();
    desc.setText("");
    chart.setDescription(desc);
    chart.getLegend().setEnabled(false);
    chart.getXAxis().setDrawGridLines(false);
    chart.getAxisLeft().setDrawGridLines(false);

    chart.invalidate();
}

public class MyBarDataset extends BarDataSet{

    private List<Float> credits;

    MyBarDataset(List<BarEntry> yVals, String label, List<Float> credits) {
        super(yVals, label);
        this.credits = credits;
    }

    @Override
    public int getColor(int index){
        float c = credits.get(index);

        if (c < 8){
            return mColors.get(0);
        }
        else if (c < 13) {
            return mColors.get(1);
        }
        else {
            return mColors.get(2);
        }
    }
}

EDITAR: Um aparte sobre o banco de dados SQL - não chame queryXData e queryYData dentro do laço! Isso extrairá toda a matriz de dados a cada iteração do loop e, novamente, dentro do próprio loop (muito caro). Basta usar algo assim em vez disso:

ArrayList<BarEntry> yVals = new ArrayList<>();
ArrayList<Integer> yData = myhelper.queryYdata();
for (int i=0; i<yData.size(); i++){
    yVals.add(new BarEntry(i,yData.get(i)));
}

ArrayList<String> xData = myhelper.queryXdata();