Mesmo que o post seja muito antigo, mas postando minha solução, demorei cerca de 2 horas para descobrir e isso pode ajudar alguém a economizar esse tempo.
Você pode tentar fazer:
shell> mysqld --initialize
Isso deve inicializar o diretório de dados no caminho onde você instalou o servidor MySql. Geralmente colocado em C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 8.0.
Espero que ajude alguém.
