Isto é pelo design do CakePHP. CakePHP sempre vê tinyint(1) como booleano, portanto, sempre converterá seu valor para true /false daí o 1 /0 .

Para superar esse problema, use tinyint(2) em vez de seu tipo de coluna. Lembre-se de limpar o cache do seu modelo!

Documentação do tipo de dados do CakePHP:
https://book.cakephp.org/3.0/en/orm/database-basics.html#data-types

Postagem no blog sobre isso:
https://blog.room34.com/archives/2649

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CakePHP e tinyint como boolean