Não consigo imaginar nenhuma boa razão para que você precise desligar isso.
Se você precisar inserir algum registro com seu
id personalizado AUTO_INCREMENT não é uma barreira. http://sqlfiddle.com/#!9/4d413/1
CREATE TABLE t1 (id int NOT NULL AUTO_INCREMENT, PRIMARY KEY (id));
INSERT INTO t1 VALUES (23);
INSERT INTO t1 VALUES (null);
Então, por que você precisa desligá-lo?
