Conforme documento no CodeIgniter Onde , você deve mencionar aqui com
OR ou AND "id=$id, name='Joe' . $where = "id=$id AND/OR name='Joe' AND status='boss'";
^^^^
Chose one
Ou use matriz
OR ou AND "id=$id, name='Joe' . $where = "id=$id AND/OR name='Joe' AND status='boss'";
^^^^
Chose one