Meu problema foi resolvido quando adicionei
spring.datasource.separator=^;
em application.properties
e cada linha fora do procedimento/trigger deve terminar com ^;
Exemplo da seguinte forma:DROP TRIGGER IF EXISTS Persons_log_update ^;
CREATE TRIGGER Persons_log_update
BEFORE UPDATE ON Persons
FOR EACH ROW
BEGIN
INSERT INTO Personshistory(PersonID,LastName,FirstName,Address,City)
values(OLD.PersonID,OLD.LastName,OLD.FirstName,OLD.Address,OLD.City);
END ^;