Se ajudar, tive o mesmo problema e consegui corrigi-lo excluindo todos os arquivos que o mysql gerou misteriosamente no diretório de dados:



Basta excluir todos os arquivos mestres e deixar sua pasta de dados como esta imagem:



Espero que isto ajude. Saúde!

EDIT - Depois de excluir todos esses arquivos, cada vez que tento iniciar o Mysql novamente, preciso excluir aria_log.00000001 (este número aumenta cada vez que inicio o Mysql). Tenha isso em mente se estiver acontecendo o mesmo novamente.