OK. Encontrei a solução. O problema foi causado por innodb_force_recovery parâmetro em my.cnf, que foi definido como 4.

Para resolver o problema, defina como 0 ou remova completamente este parâmetro de my.cnf

Se você verificar o log de erros, durante a consulta, o mysql escreverá em linguagem legível por humanos que:Não permitirá que você altere nada na tabela até que o modo de recuperação do innodb seja ativado, exatamente a próxima mensagem:

Consulte: http://bugs.mysql.com/bug.php?id=30225