multi=True é um requisito para o conector MySql. Você não pode definir esse sinalizador passando-o para métodos SQLAlchemy. Faça isso:conn = session.connection().connection
cursor = conn.cursor() # get mysql db-api cursor
cursor.execute(sql, multi=True)
Mais informações aqui:https://www.mail-archive.com /example@sqldat.com/msg30129.html