Coluna SQLAlchemy JSON - como executar uma consulta contém

Use JSON_CONTAINS(json_doc, val[, path]) :

from sqlalchemy import func

# JSON_CONTAINS returns 0 or 1, not found or found. Not sure if MySQL
# likes integer values in WHERE, added == 1 just to be safe
session.query(Story).filter(func.json_contains(Story.section_ids, X) == 1).all()

Como você está pesquisando um array no nível superior, você não precisa fornecer path . Como alternativa, a partir de 8.0.17, você pode usar value MEMBER OF(json_array) , mas usá-lo no SQLAlchemy é um pouco menos ergonômico na minha opinião:

from sqlalchemy import literal

# self_group forces generation of parenthesis that the syntax requires
session.query(Story).filter(literal(X).bool_op('MEMBER OF')(Story.section_ids.self_group())).all()