Primeiro execute esta consulta
SHOW VARIABLES LIKE '%char%';
Você tem
character_set_server='latin1'
Se sim, vá para o seu arquivo de configuração, my.cnf e adicione ou descomente estas linhas:
character-set-server = utf8
collation-server = utf8_unicode_ci
Reinicie o servidor. Sim tarde para a festa, acabei de encontrar o mesmo problema.