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Criar várias tabelas MySQL usando PHP


Você não pode usar consultas separadas por ponto e vírgula com mysql_query , esta função permite apenas uma consulta por vez!

Você deve executar suas instruções separadamente:
mysql_query("
    CREATE TABLE IF NOT EXISTS `mod_reminder_entries` (
        `id` INT(10) NOT NULL AUTO_INCREMENT, 
        `user_id` INT(10) NOT NULL, 
        `entry_name` VARCHAR(255) NOT NULL, 
        `entry_value` INT(10) NOT NULL, 
        PRIMARY KEY (`id`), 
        FOREIGN KEY (`user_id`) REFERENCES tblclients (`id`) 
    )
") or die(mysql_error());

mysql_query("
CREATE TABLE IF NOT EXISTS `second_table` (
    `user_id` INT(10) NOT NULL, 
    `fieldstotal` INT(10) NOT NULL, 
    FOREIGN KEY (`user_id`) REFERENCES tblclients (`id`) 
)
") or die(mysql_error());

Ou melhor, use mysqli_multi_query -- o que significa que você deve mudar para mysqli .