Os navegadores solicitam automaticamente o arquivo favicon.ico por padrão.
Mas você não tem nenhum arquivo favicon.ico, então ele é reescrito (regra no seu htaccess).
É por isso que você tem uma execução duplicada.
Soluções:
- Adicione um arquivo favicon.ico
- Não INSERT (em index.php) se o URL solicitado for favicon
- Não permita no seu htaccess com uma regra