Experimente o LOAD XML função (MySQL 6.0). Aqui está o código de exemplo do manual de referência:
Usando um documento XML person.xml contendo:
<?xml version="1.0"?>
<list>
<person person_id="1" fname="Pekka" lname="Nousiainen"/>
<person person_id="2" fname="Jonas" lname="Oreland"/>
<person person_id="3"><fname>Mikael</fname><lname>Ronström</lname></person>
<person person_id="4"><fname>Lars</fname><lname>Thalmann</lname></person>
<person><field name="person_id">5</field><field name="fname">Tomas</field><field name="lname">Ulin</field></person>
<person><field name="person_id">6</field><field name="fname">Martin</field><field name="lname">Sköld</field></person>
</list>
você criaria uma tabela assim:
CREATE TABLE person (
person_id INT NOT NULL PRIMARY KEY,
fname VARCHAR(40) NULL,
lname VARCHAR(40) NULL,
created TIMESTAMP
);
e use o seguinte comando para importar o XML:
LOAD XML LOCAL INFILE 'person.xml'
INTO TABLE person
ROWS IDENTIFIED BY '<person>';
Ou se você estiver executando o MySQL 5.0, você pode usar LOAD_FILE para carregar todo o documento XML como uma string em uma única coluna e, em seguida, analisá-lo usando a funcionalidade XPath do MySQL.
Este artigo no MySQL.com tem mais detalhes:Usando XML no MySQL 5.1 e 6.0 .