Execute esta consulta e você provavelmente obterá o que procura:
SELECT table_schema "DB Name",
ROUND(SUM(data_length + index_length) / 1024 / 1024, 1) "DB Size in MB"
FROM information_schema.tables
GROUP BY table_schema;
Esta consulta vem de os fóruns do mysql , onde há instruções mais abrangentes disponíveis.