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'IF' na instrução 'SELECT' - escolha o valor de saída com base nos valores da coluna

SELECT id, 
       IF(type = 'P', amount, amount * -1) as amount
FROM report

Consulte http://dev.mysql.com/ doc/refman/5.0/en/control-flow-functions.html .

Além disso, você pode manipular quando a condição for nula. No caso de valor nulo:
SELECT id, 
       IF(type = 'P', IFNULL(amount,0), IFNULL(amount,0) * -1) as amount
FROM report

A parte IFNULL(amount,0) significa quando o valor não for nulo, retorne valor, caso contrário, retorne 0 .