Este é um caso clássico de muitos para muitos e, para isso, você precisará de uma terceira tabela entre Curso e Aluno. O esquema ficará mais ou menos assim:
Course
tabela tem colunas ("course_id", "course_name") Student_course
tabela tem colunas ("student_id", "course_id"); Student
tabela como colunas ("student_id", "student_name") A tabela Student_course tem restrições de chave estrangeira nas tabelas de alunos e cursos.
Dados de exemplo:
Curso:
id | name
------------------
1 | Maths
2 | English
3 | Science
Aluna
id | name
---------------
1 | Tom
2 | Dick
3 | Harry
Aluno_curso
student_id | course_id
------------------------
1 | 1
1 | 2
2 | 1
3 | 3
Neste exemplo, o Aluno 1 (Tom) está nos cursos 1 e 2 (Matemática, Inglês),
Aluno 2 (Dick) está apenas no curso 1 (Matemática)
Aluno 3 (Harry) está apenas no curso 3 (Ciências)