Um dos formatos de data/hora suportados pelo SQLite são os timestamps Unix, ou seja, segundos desde 1970. Para converter milissegundos para isso, basta dividir por 1000.
Em seguida, use alguma função de data/hora para obter o ano e o mês:
SELECT strftime('%Y-%m', MillisField / 1000, 'unixepoch') FROM MyTable
