Finalmente encontrei a resposta com a ajuda do meu colega. Parece que o liquibase não conhece esses tipos, então precisamos modificar a consulta sql manualmente:
<createTable tableName="t_name">
...
<column name="doubleArray" type="DOUBLE_ARRAY"/>
...
</createTable>
<modifySql dbms="postgresql">
<replace replace="DOUBLE_ARRAY" with="double precision[][]"/>
</modifySql>
