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HQL - Verifica se um Array contém um valor


Para mapear as matrizes, você precisará de um tipo personalizado. Você pode usar o projeto hibernate-types para isso:https://vladmihalcea.com/how-to-map-java-and-sql-arrays-with-jpa-and-hibernate/

Você tentou usar e2.col3 = FUNCTION('ANY', e1.col3Arr) ainda? Se isso não funcionar, sugiro que você crie um SQLFunction personalizado que renderiza o SQL que você deseja, por exemplo
public class ArrayAny implements SQLFunction {

    @Override
    public boolean hasArguments() {
        return true;
    }

    @Override
    public boolean hasParenthesesIfNoArguments() {
        return true;
    }

    @Override
    public Type getReturnType(Type firstArgumentType, Mapping mapping) throws QueryException {
        return firstArgumentType;
    }

    @Override
    public String render(Type firstArgumentType, List args, SessionFactoryImplementor factory) throws QueryException {
        return "any(" + args.get(0) + ")";
    }
}

Você terá que registrar a função dentro do Dialeto.