Uma das causas para isso no passado foram problemas no caminho de importação do módulo.

Especificamente, usando uma instalação mod_wsgi compilada em uma versão do Python e, em seguida, usando WSGIPythonPath ou outros meios de definir o caminho do Python para se referir a um ambiente virtual do Python construído usando uma versão diferente do Python.

Então, valide para qual versão do Python mod_wsgi foi compilado e instalado. Se isso não for o Python 2.7, mas uma versão mais antiga do Python, você poderá obter esse problema específico.

Para saber como verificar qual mod_wsgi foi compilado para uso:

http://code.google.com/p/modwsgi/wiki/CheckingYourInstallation #Python_Shared_Library

http://code.google.com/p/modwsgi/wiki/CheckingYourInstallation #Python_Installation_In_Use

Também pode valer a pena verificar as diferenças de revisão do nível de patch do Python ao olhar para o que o mod_wsgi foi compilado. Lembro-me de que houve um problema em um ponto como esse entre o Python 2.7.1 e o 2.7.2 por aí.

Que seus pacotes de sites Python estejam em /usr/local, então é bem possível que mod_wsgi use uma versão diferente em /usr.