No meu caso, criei manualmente o script de migração do sql. No entanto, isso pode não funcionar se você decidir usar um banco de dados diferente.
operations = [
migrations.RenameModel(
old_name='Permission',
new_name='TemplatePermission',
),
migrations.RunSQL('alter sequence myapp_permission_id_seq rename to myapp_templatepermission_id_seq;'),
]
