Agora você tem 7 campos.
Você precisa mapear esses 6 campos do CSV em 6 campos na tabela.
Você não pode mapear apenas 3 campos do csv quando você tem 6 como você faz em:
\COPY agency (agency_name, agency_url, agency_timezone) FROM 'myFile.txt' CSV HEADER DELIMITER ',';
Todos os campos do arquivo csv precisam ser mapeados na cópia do comando.
E como você definiu csv
, delimitador é padrão, você não precisa colocá-lo. 
