O problema é que a consulta usada para contar é a mesma potencialmente complexa usada para buscar os dados. Isso é um desperdício.
PageNumberPagination
usa o próprio Paginator
do Django internamente. Para tornar a consulta para a contagem mais simples, substitua a classe do paginador que o DRF usa:
from django.core.paginator import Paginator
from django.utils.functional import cached_property
from rest_framework.pagination import PageNumberPagination
class FasterDjangoPaginator(Paginator):
@cached_property
def count(self):
# only select 'id' for counting, much cheaper
return self.object_list.values('id').count()
class FasterPageNumberPagination(PageNumberPagination):
django_paginator_class = FasterDjangoPaginator