Redis
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Maneira mais rápida de armazenar uma matriz numpy em redis


Não sei se é mais rápido, mas você pode tentar algo assim...

Armazenar um array Numpy no Redis é assim - veja a função toRedis() :
  • obtenha a forma do array Numpy e codifique
  • anexe a matriz Numpy como bytes à forma
  • armazenar a matriz codificada na chave fornecida

Recuperar um array Numpy é assim - veja a função fromRedis() :
  • recupere do Redis a string codificada correspondente à chave fornecida
  • extraia a forma do array Numpy da string
  • extrair dados e repovoar a matriz Numpy, remodelar para a forma original
#!/usr/bin/env python3

import struct
import redis
import numpy as np

def toRedis(r,a,n):
   """Store given Numpy array 'a' in Redis under key 'n'"""
   h, w = a.shape
   shape = struct.pack('>II',h,w)
   encoded = shape + a.tobytes()

   # Store encoded data in Redis
   r.set(n,encoded)
   return

def fromRedis(r,n):
   """Retrieve Numpy array from Redis key 'n'"""
   encoded = r.get(n)
   h, w = struct.unpack('>II',encoded[:8])
   # Add slicing here, or else the array would differ from the original
   a = np.frombuffer(encoded[8:]).reshape(h,w)
   return a

# Create 80x80 numpy array to store
a0 = np.arange(6400,dtype=np.uint16).reshape(80,80) 

# Redis connection
r = redis.Redis(host='localhost', port=6379, db=0)

# Store array a0 in Redis under name 'a0array'
toRedis(r,a0,'a0array')

# Retrieve from Redis
a1 = fromRedis(r,'a0array')

np.testing.assert_array_equal(a0,a1)

Você pode adicionar mais flexibilidade codificando o dtype da matriz Numpy junto com a forma. Eu não fiz isso porque pode ser o caso de você já saber que todos os seus arrays são de um tipo específico e então o código seria apenas maior e mais difícil de ler sem motivo.

Referência aproximada no iMac moderno :
80x80 Numpy array of np.uint16   => 58 microseconds to write
200x200 Numpy array of np.uint16 => 88 microseconds to write

Palavras-chave :Python, Numpy, Redis, array, serialize, serialize, key, incr, unique