Se você ainda precisa usar um pacote, agora há um disponível no repositório de testes com o qual você pode tentar.
http://dl-3.alpinelinux.org/alpine/edge/ testando/x86_64/
echo 'http://dl-3.alpinelinux.org/alpine/edge/testing' >> /etc/apk/repositories
apk upgrade --update
apk add mongodb
