Existem algumas maneiras de executar código javascript arbitrário no servidor. Você pode fornecê-lo como uma string do cliente e enviá-lo ao servidor para avaliação, ou instalar a função no servidor primeiro, conforme documentado aqui:http://docs.mongodb.org/manual/core/server-side-javascript/
As funções do lado do servidor são registradas por db, em uma coleção chamada system.js.
De qualquer forma, você pode usar o comando db.eval() para chamar seu código, conforme mostrado aqui:
/* Call like so:
evalJavascript(myDB, "function (oid) { return coll.find({_id: oid}); }", someObjectId)
*/
def evalJavascript(db:MongoDB, func: String, args: String*): Validation[String, Object] = {
val result = db.command(Map(
"eval" -> func,
"args" -> args.toList
));
if (result.ok) {
result.get("retval").success
} else {
result.getErrorMessage().failure
}
}