Você tem que importar o Codec DBRef para imprimi-lo, se você quiser em um documento estilo json você precisa escrever seu próprio Codec para DBRef e adicioná-lo ao codecregistry que você dá para Json().
por exemplo.
CodecRegistry codecRegistry = MongoClientSettings.getDefaultCodecRegistry();
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final DocumentCodec codec = new DocumentCodec(codecRegistry, new BsonTypeClassMap());
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System.out.println(document.toJson(codec));