Deve fazer o truque:
db.emails.find({ $expr: { $gt: [ "$bounceCount" , "$sentCount" ] } });
Aqui está a referência onde encontrei:https://docs.mongodb.com/manual/reference/operator/query/expr/#op._S_expr
db.emails.find({ $expr: { $gt: [ "$bounceCount" , "$sentCount" ] } });
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