Para isso, configure duas unidades de persistência apontando para bancos de dados diferentes no arquivo persistence.xml.
<persistence>
<persistence-unit name="oracleDB">
<jta-data-source>java:/OracleDB</jta-data-source>
...
</persistence-unit>
<persistence-unit name="ingresDB">
<jta-data-source>java:/ingresDB</jta-data-source>
...
</persistence-unit>
</persistence>
O contexto de persistência é injetado usando a anotação do contêiner para a unidade de persistência fornecida.
@PersistenceContext(unitName="oracleDB")
private EntityManager oracleEntityManager;
@PersistenceContext(unitName="ingresDB")
private EntityManager ingresEntityManager;
Em seguida, você pode executar a operação em bancos de dados usando a respectiva instância entityManager.
O nome/estrutura da tabela deve ser o mesmo em ambos os bancos de dados e evite usar a funcionalidade nativa fornecida pelos fornecedores para portabilidade.