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A junção externa esquerda do Oracle XMLTABLE não retorna resultados quando o XPath não existe


Você não precisa de várias chamadas para XMLTable, você pode mover a seleção do elemento para a cláusula de caminho da coluna e ter três dessas cláusulas:
select x.id1, x.id2, x.id3
from tbl t
cross join
  xmltable ('/root'
    passing t.xml_data
    columns id1 varchar2 (100) path 'element[id=1]/data',
       id2 varchar2 (100) path 'element[id=2]/data',
       id3 varchar2 (100) path 'element[id=3]/data'
) x;

ID1   ID2   ID3 
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abc   def