([^,]+)(,[ ]*\1)+
Tente isso. Isso funciona. Veja a demonstração.
http://regex101.com/r/yG7zB9/8
O problema era
VA - HRD 1, VA - HRD 1
^ ^
O espaço aqui. Você não estava levando isso em consideração, pois a primeira correspondência não tem espaço oculto. Então, inlcde
[ ]*
ou \s*
para fazê-lo aceitar.