Eu tive exatamente o mesmo problema após uma nova instalação do VS2017.
- Instalou o VS2017 (edição corporativa, no meu caso).
- Antes, a ODT não funcionava na edição da comunidade, mas a Oracle pode ter corrigido isso.
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Oracle Developer Tools for Visual Studio 2017 instalado
- ODT quebrou o VS2017 e eu tive que fazer um "reparo", que resolveu o problema onde o VS2017 nem iniciava. Foi aqui que começou o problema que você descreveu.
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Reinstalado o ODAC 12.2c Release 1 e Oracle Developer Tools forVisual Studio (12.2. 0.1.0)
- Ele foi instalado anteriormente para o VS2015.
Agora, tudo funciona como esperado e posso, por exemplo, atualizar meus modelos EF6.