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Oracle exibe mais de 24 horas


Você precisa separar a diferença de horário em seus elementos constituintes de dia, hora, minuto e segundo, combinar o número de dias * 24 com o número de horas e juntá-los novamente.

Ao subtrair datas você obtém a diferença como o número de dias, então você precisa converter a parte fracionária nos outros elementos, o que você pode fazer com uma combinação de trunc e mod; usando um CTE para tornar isso um pouco mais fácil de seguir e mostrando cada valor por conta própria, bem como combinados em uma única string:
with y as (
  select id, end_time - start_time as runtime
  from mytable
)
select id,
  runtime,
  trunc(runtime) as days,
  24 * trunc(runtime) as day_hours,
  trunc(24 * mod(runtime, 1)) as hours,
  trunc(60 * mod(24 * (runtime), 1)) as minutes,
  trunc(60 * mod(24 * 60 * (runtime), 1)) as seconds,
  lpad(24 * trunc(runtime)
    + trunc(24 * mod(runtime, 1)), 2, '0')
    ||':'|| lpad(trunc(60 * mod(24 * (runtime), 1)), 2, '0')
    ||':'|| lpad(trunc(60 * mod(24 * 60 * (runtime), 1)), 2, '0')
    as runtime
from y;

        ID    RUNTIME       DAYS  DAY_HOURS      HOURS    MINUTES    SECONDS RUNTIME 
---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------
         1 .184918981          0          0          4         26         16 04:26:16 
         2 1.14465278          1         24          3         28         18 27:28:18 

Você também pode converter as datas em carimbos de data/hora para o cálculo, o que fornece um tipo de intervalo e, em seguida, usar o extract função para obter os elementos em vez disso; mas o principal é o mesmo:
with y as (
  select id,
    cast(end_time as timestamp) - cast (start_time as timestamp) as runtime
  from mytable
)
select id,
  runtime,
  extract (day from runtime) as days,
  24 * extract (day from runtime) as day_hours,
  extract (hour from runtime) as hours,
  extract (minute from runtime) as minutes,
  extract (second from runtime) as seconds,
  lpad(24 * extract (day from runtime) + extract (hour from runtime), 2, '0')
    ||':'|| lpad(extract (minute from runtime), 2, '0')
    ||':'|| lpad(extract (second from runtime), 2, '0')
    as runtime
from y;

        ID RUNTIME           DAYS  DAY_HOURS      HOURS    MINUTES    SECONDS RUNTIME 
---------- ----------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------
         1 0 4:26:17.0          0          0          4         26         17 04:26:17 
         2 1 3:28:18.0          1         24          3         28         18 27:28:18 

Ou uma pequena variação, obtendo a diferença das datas e depois convertendo isso em um intervalo:
with y as (
  select id,
    numtodsinterval(end_time - start_time, 'DAY') as runtime
  from mytable
)
...

Demonstração do SQL Fiddle.