A razão pela qual você está recebendo esse erro provavelmente é que você está atingindo o tempo limite. Aumente o ExecutionTimeout, pois no padrão são 110 segundos.
<compilation debug="false"></compilation>
<httpRuntime executionTimeout="1800"/> //1800 seconds / 30 minutes.
Aqui está um artigo que entra em mais detalhes sobre como aumentar o ExecutionTimeout.
