você pode usar a construção except para fazer a correspondência entre as duas consultas.
select * from (select * from query1) as query1
except
select * from (select * from query2) as query2
EDITAR:
Em seguida, inverta a consulta para encontrar diferenças com query2 como driver:
select * from (select * from query2) as query2
except
select * from (select * from query1) as query1