No meu caso, o SELinux (estou usando o CentOS) estava bloqueando a conexão quando feita do servidor web Apache na caixa linux para o servidor sql na caixa windows. Para permitir a conexão você tem duas opções:
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Desabilitar SELinux
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Como root ou sudo execute os dois comandos:
Para verificar se o SELinux está bloqueando sua rede e conexões de banco de dados, execute este comando:
Se os resultados forem:
Você é bom, se estiver desligado, execute os primeiros comandos nesta resposta.