.NET 4:Como configurar o arquivo EDMX em outro assembly no Web.Config

Você tem que alterar o * na string de conexão do nome do assembly em que os arquivos .edmx estão:

<add name="Entities" connectionString="metadata=res://*/Models.EF.Model.csdl|res://*/Models.EF.Model.ssdl|res://*/Models.EF.Model.msl;provider=System.Data.SqlClient;provider connection ... ;" providerName="System.Data.EntityClient" />

por

<add name="Entities" connectionString="metadata=res://Project2/Models.EF.Model.csdl|res://Project2/Models.EF.Model.ssdl|res://Project2/Models.EF.Model.msl;provider=System.Data.SqlClient;provider connection ... ;" providerName="System.Data.EntityClient" />