Eu uso a funcionalidade de comparação de esquema e dados incorporada na versão mais recente Microsoft Visual Studio 2015 Community Edition (Grátis) ou Professional / Premium / Ultimate edition. Funciona como um encanto!
http://channel9.msdn.com/Events/Visual-Studio/Launch-2013/VS108
Ferramenta de comparação de dados SQL da Red-Gate é minha segunda alternativa:
(fonte:spaanjaars.com)
- http://www.red-gate.com/products/sql-development/sql-compare/
- http://www.red-gate.com/products/sql-development/sql-data-compare/