Suponho aqui que você criou um banco de dados chamado 'mybase' e usa o usuário 'root' sem senha (não faça isso na vida real).
Você deve se lembrar de adicionar o caminho do arquivo jar do conector mysql ao caminho de classe java. Você pode fazer isso adicionando o caminho a classpath.txt (\toolbox\local) ou usando
javaclasspath comando diretamente do Matlab. Você pode estabelecer sua conexão assim:
dbname = 'mybase';
username = 'root';
password = '';
driver = 'com.mysql.jdbc.Driver';
dburl = ['jdbc:mysql://localhost:3306/' dbname];
javaclasspath('path-to-mysql-connector\mysql-connector-java-VERSION-bin.jar');
conn = database(dbname, username, password, driver, dburl);
