Não.
É apenas uma daquelas coisas que acontecem quando uma equipe de pessoas projeta um produto.
Diferentes convenções são usadas levando à inconsistência.
Veja aqui:http://dev.mysql. com/doc/refman/5.5/en/mysqld-option-tables.html
E role até as opções começando com
ssl , você verá o que quero dizer. 
