Você poderia tentar executar o binário ssh do Java? Por exemplo:
Runtime rt = Runtime.getRuntime();
Process pr = rt.exec("ssh -L 1234:localhost:3306 mysql.server.remote");
Obviamente, isso requer que um sistema tenha o ssh instalado em um PATH.
Runtime rt = Runtime.getRuntime();
Process pr = rt.exec("ssh -L 1234:localhost:3306 mysql.server.remote");
