Mysql
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Dividindo dados mysql em 3 colunas de erro


A correção mais rápida é que você precisa de um "break " no loop interno. 
for ($i=0; $i < count($data)/3; $i++){
    for ($j=0; $j<3; $j++){
         if (($i * 3) + $j >= count($data)) {
             break;
         }

Observe que você deve economizar um pouco de poder de computação armazenando count($data) em uma variável - a menos que espere que a contagem mude. 
$countOfData = count($data);
for ($i=0; $i < $countOfData/3; $i++){
    for ($j=0; $j<3; $j++){
         if (($i * 3) + $j >= $countOfData) {
             break;
         }