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Pare o sql de atualizar campos em branco ou vazios do meu formulário de atualização

UPDATE `tablename`
SET `field` = IF(? <> '', ?, `field`)
WHERE ...

Isso substitui o trabalho de verificar entradas vazias no MySQL e o campo usa seu valor anterior em vez de um valor vazio. Você precisa passar o valor para execute() duas vezes para que isso funcione. Ele faz basicamente a mesma coisa que você está fazendo, mas sem ter que armazenar o valor em sua sessão PHP.

Usando essa abordagem, seu código de atualização ficaria assim:
/*
  This block is no longer necessary
if($_POST['firstname']){ $firstname = $_POST['firstname']; }
else { $firstname = $_SESSION['uname']['firstname']; }

if($_POST['lastname']){ $lastname = $_POST['lastname']; }
else { $lastname = $_SESSION['uname']['lastname']; }

if($_POST['email']){ $email= $_POST['email']; }
else { $email = $_SESSION['uname']['email']; }
*/

$query = "
  UPDATE `users`
  SET
    `firstname` = IF(? <> '', ?, `firstname`),
    `lastname` = IF(? <> '', ?, `lastname`),
    `email` = IF(? <> '', ?, `email`)
  WHERE `id` = ?
";

$results = $condb->prepare($query);

$results->execute(array(
  $_POST['firstname'], $_POST['firstname'],
  $_POST['lastname'], $_POST['lastname'],
  $_POST['email'], $_POST['email'],
  $_SESSION['uname']['id']
));

Seu código existente teria impedido o usuário de inserir um único 0 por conta própria, o que isso não vai acontecer - você pode querer adicionar uma verificação para isso também.