Com JPA você precisa fazer como seguir
int num = ((Number)this.entityManager.createNativeQuery("select count(*) from your_table_name")
.getSingleResult()).intValue();
editado:
String name = this.entityManager.createNativeQuery("select t.name from your_table_name t limit 1").getSingleResult().toString();
você terá contagem com num objeto
Espero que seu irá ajudá-lo.