Para habilitar o Log Query completo, adicione o seguinte ao seu my.cnf:
log=/var/log/mysqldquery.log
O acima registrará todas as consultas no arquivo de log.
Não se esqueça de reiniciar o serviço mysql depois de fazer alterações no arquivo my.cnf.
Exemplo de saída de ações via SequelPro (cliente mac):
090721 11:06:45 51 Query ALTER TABLE `test` ADD `name` varchar(10) DEFAULT NULL
51 Query SHOW COLUMNS FROM `test`
51 Query SHOW INDEX FROM `test`
090721 11:06:57 51 Query SHOW COLUMNS FROM `test`
51 Query UPDATE `test` SET `id`='1', `name`='test' WHERE `id` = '1' AND `name` IS NULL LIMIT 1
51 Query SELECT * FROM `test` LIMIT 0,100
51 Query SELECT COUNT(1) FROM `test`
090721 11:07:00 51 Query UPDATE `test` SET `id`='2', `name`='test' WHERE `id` = '2' AND `name` IS NULL LIMIT 1
51 Query SELECT * FROM `test` LIMIT 0,100
51 Query SELECT COUNT(1) FROM `test`
Em sistemas baseados em *NIX, você pode usar grep para iniciar
grep 'SELECT\|INSERT\|UPDATE' querylog.log
Ou fique mais complicado e comece a fazer coisas como:
grep 'SELECT\|INSERT\|UPDATE' querylog.log | awk '{$1="";$2="";print}'
Isso lhe daria algo assim, não perfeito, mas mais próximo:
51 Query UPDATE `test` SET `id`='2', `name`='test' WHERE `id` = '2' AND `name` IS NULL LIMIT 1
SELECT * FROM `test` LIMIT 0,100
SELECT COUNT(1) FROM `test`
51 Query INSERT INTO `test` (`id`,`name`) VALUES ('3','testing')
SELECT * FROM `test` LIMIT 0,100
SELECT COUNT(1) FROM `test`