Eu estava olhando para o lugar errado! O problema não estava vindo do corredor, mas do próprio SONAR. Eu tive que alterar o arquivo de configuração do sonar '/opt/sonar' e reiniciá-lo. Na página de configuração, agora posso ver que o sonar está sendo executado no mysql. Estou enfrentando outro problema com o runner, mas não está relacionado ao problema acima.

Então, basicamente, certifique-se de que o SONAR e o SONAR-RUNNER estejam configurados para funcionar com o mysql.