A Navicat pode fazer isso por você. Ele também sincronizará o esquema e/ou dados entre duas instâncias do banco de dados mysql. Já usei com sucesso no passado.

http://www.navicat.com/en/products/navicat_mysql/mysql_overview .html

Há uma captura de tela da ferramenta de sincronização de dados e estrutura aqui:

http://www.navicat.com/en/products/navicat_mysql /mysql_detail_mac.html#7